1)He comes to ___school by __bus.This morning __ bus was late.2）The passage tells you how get to

1.He comes to school by bus.This morning the bus was late.
2.The passage tells you how to get to the school when you come out of the station.
come/go to school是去上学的意思,这里的school不是“地点”学校的意思,而是一个事件,指的是去上课,因此不需要用冠词来指代.by bus 是固定搭配,by+交通方式中间没有冠词.the bus中,因为bus 是可数名词,不能独立出现,需要冠词来指代,因为到这里的汽车是特定的某路车,因此要用定冠词the 来特指,而不能用a或者an来泛指.
而第二题的汉语意思是,这段话告诉你如何从车站到达学校,这里的学校是特指的某个地点,因此要用定冠词the加以限制.